Mit dem Bau der Augustinerkirche in Würzburg wurde im Jahr 1266 im Auftrag der Dominikaner begonnen, die seit 1227 in Würzburg lebten. Der gotische Bau wurde 1308 abgeschlossen. 1741 erhielt Balthasar Neumann den Auftrag, die Kirche im barocken Stil umzugestalten. Er ließ das gotische Hauptschiff vollständig abreißen und erstellte einen barocken Neubau, den er mit dem barockisierten Chor-/Apsisbereich verband.
Im Jahr 1813 mussten die seit 1263 in Würzburg ansässigen Augustiner (Eremiten) ihr Kloster (am Platz des heutigen Polizeipräsidiums) räumen und bezogen das leerstehende Dominikanerkloster. Durch den Bombenangriff auf Würzburg am 16. März 1945 verlor die Kirche nahezu ihre gesamte Innenausstattung.
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